Główną bohaterką powieści Ewy Nowackiej jest tytułowa Małgosia – dziewczynka niezbyt grzeczna i krnąbrna, która pewnego dnia musi zostać w domu całkiem sama. W wyniku dziwnych okoliczności stwierdza, że przenosi się w czasie, do przeszłości. Trafia w miejsce, w którym panowały zupełnie inne realia niż we współczesnej jej rzeczywistości, a na porządku dziennym są raczej sztywne maniery. Mieszkańcy tego nowego miejsca próbują podporządkować ją swoim wyobrażeniom, co niezbyt podoba się bohaterce.
Nowa rodzina planuje jej małżeństwo, jednak dziewczynka pragnie jak najszybciej powrócić do domu. Zanim jednak jej się to udaje, zmuszona jest wieść życie całkiem nowej Małgosi, przystosowanej do panujących wokół nie warunków i oczekiwań. W nowym świecie poznaje postacie takie jak Klara czy Panna Franciszka. Zawiązuje też wiele innych znajomości i przeżywa różnorakie przygody. W jej życiu pojawia się także pewien tajemniczy Głos, który bohaterka słyszy w ciemnościach. W ten sposób poznaję Dytkę. W nowej rzeczywistości Małgosia zachowuje się dość swobodnie i wyzywająco, czym zaskarbia sobie uwagę licznych adoratorów. Dziewczyna bawi się jednak uczuciami mężczyzn, przez co wpada w poważne tarapaty. Wówczas dziewczyna za wszelką cenę próbuje wrócić do domu, gdyż nowa rodzina zapowiedziała jej przyszłość w klasztorze.
Szczęśliwie jednak Małgosia wraca do swojej współczesności i właściwej rodziny. Przygody bohaterki zupełnie odmieniają jej charakter – staje się grzeczną, sumienną i przykładną córką, chętnie pomagającą w domowych obowiązkach. Po niedługim czasie bohaterka odkrywa, że podczas jej nieobecności życie toczyło się tutaj dalej, a jej miejsce zajęła wówczas inna Małgosia pochodząca z kolei z przeszłości, z XVII wieku.